AT5G24360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : inositol requiring 1-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
inositol requiring 1-1 (IRE1-1); FUNCTIONS IN: endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, mRNA processing; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat (InterPro:IPR018391), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), KEN domain, ribonuclease activator (InterPro:IPR010513), PUG domain (InterPro:IPR006567), Quinonprotein alcohol dehydrogenase-like (InterPro:IPR011047); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Endoribonuclease/protein kinase IRE1-like (TAIR:AT2G17520.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:8316627..8319827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 99621.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 881 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRGSALLDLI LFLLVSPLAH SFKGSEISKF YDKSISNQIS QSDRESGYVL VSTVDGSISL VDMSSQKLDW TFHTNEPIYS SYQAPHYHYT TDEERSSVLG 101: DDFYMDCDKD WRLYNSSVRK GKRVNEIVDA SEFIGTLPYT STDRIVLGKK DTSVFLLDWK TGKLVKRYRM DELYSNTVVE NDKEKAIVLS KEAPLLFGSG 201: FKKSEDFPEL VYIERKDFKI QCISKFGDVL WSVSYAKMEA KLQNHESVQF ISGLSSSVGK NQFPLSYTTS VPMVQLRNVK YETLFPRLGF LDEALYLPFQ 301: DRKPNQLAIG DGNQLTLPGN KEAEEVLSLP LPETVISQIT DIIDGSTKQA GFASKFSGLI VLIFGFCVTM LSVCGLFFYR LRQSIRIKEP YVSEVPIATP 401: KKKKSKKNGT TKAVHKKENG FISGGNKDPS HEENEKRLLT AFPGLNNSSA EGYRVGKLFV SNKEIAKGSN GTVVLEGSYE GRLVAVKRLV QSHHDVAQKE 501: ILNLMASDKH SNIVRWYGVD QDEHFIYISL ELCACSLNDL IYASSALLES PMASSSIHSI QINPIFENGK GVELWKENGH PSPVLLKLMR DIVAGLVHLH 601: DIGIVHRDLK PQNVLIVKNS SLCAKLSDMG ISKRLPADTS ALTRNSTGLG SGSSGWQAPE QLRNERQTRA VDLFSLGCVL FFCMTGGKHP YGDNYERDVN 701: VLNDQKDLFL IESLPEAVHL LTGLLNPDPN LRPRAQDVMH HPLFWNSDMR LSFLRDASDR VELENREEGS QLLAALESTA AVTLNGRWDE KLDSIFLDNI 801: GRYRRYKFDS IRDLLRVIRN KLNHYRELPK ELQELLGSVP EGFERYFSSR FPKLLIQVYT VLFDYCNNEE FFFKYSKTTV F |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)