AT4G34490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.828 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cyclase associated protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
CYCLASE ASSOCIATED PROTEIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cyclase associated protein 1 (CAP1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclase-associated protein CAP/septum formation inhibitor MinC, C-terminal (InterPro:IPR016098), CAP, conserved site (InterPro:IPR018106), Adenylate cyclase-associated CAP (InterPro:IPR001837), CARP motif (InterPro:IPR006599), Adenylate cyclase-associated CAP, N-terminal (InterPro:IPR013992), C-CAP/cofactor C-like domain (InterPro:IPR017901), Adenylate cyclase-associated CAP, C-terminal (InterPro:IPR013912); Has 618 Blast hits to 612 proteins in 211 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 296; Fungi - 160; Plants - 51; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 109 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:16484896..16487355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50972.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 476 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEEDLIKRLE AAVTRLEGIS SNGGGVVSLS RGGDFSSAAG IDIASSDPSI LAYEDLISQC VGRALTAAEK IGGPVLDVTK IVAEAFASQK ELLVRIKQTQ 101: KPDLAGLAGF LKPLNDVTMK ANAMTEGKRS DFFNHLKAAC DSLSALAWIA FTGKDCGMSM PIAHVEESWQ MAEFYNNKVL VEYRNKDADH VEWAKALKEL 201: YLPGLREYVK SHYPLGPVWN ASGKPASAPA KGPPGAPAPP PAPLFSAESS KPSSSSNQKQ GMSAVFQQLS SGAVTSGLRK VTDDMKTKNR ADRSGAVSAV 301: EKETRTSKPA FSKTGPPKME LQMGRKWAVE NQIGKKDLVI SECDSKQSVY IYGCKDSVLQ IQGKVNNITI DKCTKVGVVF TDVVAAFEIV NCNNVEVQCQ 401: GSAPTVSVDN TTGCQLYLNK DSLETAITTA KSSEINVMVP GATPDGDWVE HALPQQYNHV FTEGKFETTP VSHSGA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)