AT4G31790.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.827 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases; FUNCTIONS IN: methyltransferase activity, diphthine synthase activity; INVOLVED IN: peptidyl-diphthamide biosynthetic process from peptidyl-histidine, metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Diphthine synthase (InterPro:IPR004551), Tetrapyrrole methylase (InterPro:IPR000878), Tetrapyrrole methylase, subdomain 1 (InterPro:IPR014777), Tetrapyrrole methylase, subdomain 2 (InterPro:IPR014776); Has 1000 Blast hits to 999 proteins in 351 species: Archae - 460; Bacteria - 44; Metazoa - 134; Fungi - 154; Plants - 44; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 164 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15377479..15378530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30792.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 277 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLYIIGLGLG DEKDITLRGL EAVKKSQKVY MEAYTSLLSF GLSADGLSNL EKFYGKPIIL ADREMVEEKA GDMIDEAIDN DVAFLVVGDP FGATTHSDLV 101: VRAKTLGVKV EVVHNASVMN AVGICGLQLY HYGETVSIPF FTETWRPDSF YEKIKKNRSL GLHTLCLLDI RVKEPTFESL CRGGKKQYEP PRYMSVNTAI 201: EQLLEVEQKH GDSVYGEDTQ CVGFARLGSE DQTIVAGTMK QLESVDFGAP LHCLVIVGET HPVEEEMLEF YKYKSGN |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)