AT3G58790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.971 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with putative galacturonosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase 15 (GAUT15); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galacturonosyltransferase 14 (TAIR:AT5G15470.1); Has 1513 Blast hits to 1502 proteins in 296 species: Archae - 0; Bacteria - 573; Metazoa - 140; Fungi - 8; Plants - 775; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 15 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21742455..21745972 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60623.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 540 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKFYISATGI KKVTISNPGV GIGKGSGGCA AAAAALAARR FSSRTLLLLL LLLAIVLPFI FVRFAFLVLE SASVCDSPLD CMGLRLFRGG DTSLKIGEEL 101: TRALVEETTD HQDVNGRGTK GSLESFDDLV KEMTLKRRDI RAFASVTKKM LLQMERKVQS AKHHELVYWH LASHGIPKSL HCLSLRLTEE YSVNAMARMR 201: LPPPESVSRL TDPSFHHIVL LTDNVLAASV VISSTVQNAV NPEKFVFHIV TDKKTYTPMH AWFAINSASS PVVEVKGLHQ YDWPQEVNFK VREMLDIHRL 301: IWRRHYQNLK DSDFSFVEGT HEQSLQALNP SCLALLNHLR IYIPKLFPDL NKIVLLDDDV VVQSDLSSLW ETDLNGKVVG AVVDSWCGDN CCPGRKYKDY 401: FNFSHPLISS NLVQEDCAWL SGMNVFDLKA WRQTNITEAY STWLRLSVRS GLQLWQPGAL PPTLLAFKGL TQSLEPSWHV AGLGSRSVKS PQEILKSASV 501: LHFSGPAKPW LEISNPEVRS LWYRYVNSSD IFVRKCKIMN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)