AT3G25140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.500 mitochondrion 0.500 ASURE: golgi,mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Quasimodo1, encodes a glycosyltransferase, involved in homogalacturonan biosynthesis; mutant shows cell adhesion defect and lower wall uronic acid content. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
QUASIMODO 1 (QUA1); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: carbohydrate biosynthetic process, pectin biosynthetic process, homogalacturonan biosynthetic process; LOCATED IN: mitochondrion, Golgi apparatus; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galacturonosyltransferase 9 (TAIR:AT3G02350.1); Has 1333 Blast hits to 1331 proteins in 208 species: Archae - 0; Bacteria - 350; Metazoa - 145; Fungi - 2; Plants - 818; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 18 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:9154748..9156642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64371.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 559 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANHHRLLRG GGSPAIIGGR ITLTAFASTI ALFLFTLSFF FASDSNDSPD LLLPGVEYSN GVGSRRSMLD IKSDPLKPRL IQIRKQADDH RSLALAYASY 101: ARKLKLENSK LVRIFADLSR NYTDLINKPT YRALYDSDGA SIEESVLRQF EKEVKERIKM TRQVIAEAKE SFDNQLKIQK LKDTIFAVNE QLTNAKKQGA 201: FSSLIAAKSI PKGLHCLAMR LMEERIAHPE KYTDEGKDRP RELEDPNLYH YAIFSDNVIA ASVVVNSAVK NAKEPWKHVF HVVTDKMNLG AMQVMFKLKE 301: YKGAHVEVKA VEDYTFLNSS YVPVLKQLES ANLQKFYFEN KLENATKDTT NMKFRNPKYL SILNHLRFYL PEMYPKLHRI LFLDDDVVVQ KDLTGLWEID 401: MDGKVNGAVE TCFGSFHRYA QYMNFSHPLI KEKFNPKACA WAYGMNFFDL DAWRREKCTE EYHYWQNLNE NRALWKLGTL PPGLITFYST TKPLDKSWHV 501: LGLGYNPSIS MDEIRNAAVV HFNGNMKPWL DIAMNQFRPL WTKHVDYDLE FVQACNFGL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)