AT2G47490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD+ transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a chloroplast-localized NAD+ transporter that transports NAD+ in a counter exchange mode with ADP and AMP in vitro. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NAD+ transporter 1 (NDT1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial carrier protein (InterPro:IPR002067), Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108), Adenine nucleotide translocator 1 (InterPro:IPR002113); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD+ transporter 2 (TAIR:AT1G25380.1); Has 28896 Blast hits to 14510 proteins in 466 species: Archae - 0; Bacteria - 6; Metazoa - 12245; Fungi - 8541; Plants - 5076; Viruses - 8; Other Eukaryotes - 3020 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:19487549..19489311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33885.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 312 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSANSHPPNS KNVLCNAAAG AAAGVVAATF VCPLDVIKTR FQVHGLPKLG DANIKGSLIV GSLEQIFKRE GMRGLYRGLS PTVMALLSNW AIYFTMYDQL 101: KSFLCSNDHK LSVGANVLAA SGAGAATTIA TNPLWVVKTR LQTQGMRVGI VPYKSTFSAL RRIAYEEGIR GLYSGLVPAL AGISHVAIQF PTYEMIKVYL 201: AKKGDKSVDN LNARDVAVAS SIAKIFASTL TYPHEVVRAR LQEQGHHSEK RYSGVRDCIK KVFEKDGFPG FYRGCATNLL RTTPAAVITF TSFEMVHRFL 301: VTHIPSEQSS IL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)