AT2G46880.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.925 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 14 (PAP14); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, acid phosphatase activity; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: leaf whorl, sepal, flower; EXPRESSED DURING: petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Phosphoesterase At2g46880 (InterPro:IPR011230); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 29 (TAIR:AT5G63140.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:19264910..19266412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45578.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 401 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEETRRRFVI SSVLSVSLIY LCLSTCHVSA FDFGRRQLRF NTDGRFKILQ VSDMHYGFGK ETQCSDVSPA EFPYCSDLNT TSFLQRTIAS EKPDLIVFSG 101: DNVYGLCETS DVAKSMDMAF APAIESGIPW VAILGNHDQE SDMTRETMMK YIMKLPNSLS QVNPPDAWLY QIDGFGNYNL QIEGPFGSPL FFKSILNLYL 201: LDGGSYTKLD GFGYKYDWVK TSQQNWYEHT SKWLEMEHKR WPFPQNSTAP GLVYLHIPMP EFALFNKSTE MTGVRQESTC SPPINSGFFT KLVERGEVKG 301: VFSGHDHVND FCAELHGINL CYAGGAGYHG YGQVGWARRV RVVEAQLEKT MYGRWGAVDT IKTWKRLDDK NHSLIDTQLL WTKNTTLEPN FGFSCSTIPQ 401: H |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)