AT4G36350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 25 (PAP25); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, acid phosphatase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cell wall; EXPRESSED IN: petal, leaf whorl, sepal, flower, cultured cell; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Purple acid phosphatase, N-terminal (InterPro:IPR015914), Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Purple acid phosphatase-like, N-terminal (InterPro:IPR008963); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 6 (TAIR:AT1G56360.1); Has 1905 Blast hits to 1883 proteins in 391 species: Archae - 5; Bacteria - 595; Metazoa - 186; Fungi - 82; Plants - 767; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 270 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:17173737..17175857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52971.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 466 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRMNKILLVF VFLSIATVIN SGTTSNFVRT AQPSTEMSLE TFPSPAGHNA PEQVHIVQGD YNGRGIIISW VTPLNLAGSN VVTYWKAVDG DVKPKKKRGH 101: ASTSSYRFYD YTSGFLHHAT IKGLEYDTKY IYEVGTDGSV RQFSFTSPPK VGPDVPYTFG IIGDLGQTLA SNETLYHYMS NPKGQAVLFP GDLSYADDHP 201: NHDQRKWDSW GRFVEPCAAY QTFIYAAGNH EIDFVPNIGE PHAFKPYIHR YHNAYKASKS ISPLWYSIRR ASAHIIVLSS YSAYGKYTPQ YVWLEQELKK 301: VNREETPWLI VMVHSPWYNS NNYHYMEGES MRAMFESWFV NSKVDLVLSG HVHSYERSER VSNIKYNITN GLSYPVKDPS APIYITIGDG GNIEGIANSF 401: TDPQPSYSAY REASFGHAVL EIYNRTHAYY TWHRNQDNEP VAADSIMLHN RYFFPVEELE SGNTRA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)