AT2G27810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nucleobase-ascorbate transporter 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nucleobase-ascorbate transporter 12 (NAT12); FUNCTIONS IN: transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Xanthine/uracil/vitamin C permease (InterPro:IPR006043); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Xanthine/uracil permease family protein (TAIR:AT4G38050.1); Has 9528 Blast hits to 9485 proteins in 1925 species: Archae - 69; Bacteria - 7579; Metazoa - 494; Fungi - 167; Plants - 469; Viruses - 16; Other Eukaryotes - 734 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:11852338..11855988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 76678.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 709 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSSDPKPGP KPGPWPPTPE SAAMPPSSWA KKTGFRPKFS GETTATDSSS GQLSLPVRAK QQETQPDLEA GQTRLRPPPP VSAAVTNGET DKDKKEKPPP 101: PPPGSVAVPV KDQPVKRRRD SDGVVGRSNG PDGANGSGDP VRRPGRIEET VEVLPQSMDD DLVARNLHMK YGLRDTPGLV PIGFYGLQHY LSMLGSLILV 201: PLVIVPAMGG SHEEVANVVS TVLFVSGITT LLHTSFGSRL PLIQGPSFVF LAPALAIINS PEFQGLNGNN NFKHIMRELQ GAIIIGSAFQ AVLGYSGLMS 301: LILRLVNPVV VAPTVAAVGL SFYSYGFPLV GKCLEIGVVQ ILLVIIFALY LRKISVLSHR IFLIYAVPLS LAITWAAAFL LTETGAYTYK GCDPNVPVSN 401: VVSTHCRKYM TRMKYCRVDT SHALSSAPWF RFPYPLQWGV PLFNWKMAFV MCVVSVIASV DSVGSYHASS LLVASRPPTR GVVSRAIGLE GFTSVLAGLW 501: GTGTGSTTLT ENVHTIAVTK MGSRRVVELG ACVLVIFSLV GKVGGFLASI PQVMVASLLC FMWAMFTALG LSNLRYSEAG SSRNIIIVGL SLFFSLSVPA 601: YFQQYGISPN SNLSVPSYYQ PYIVSSHGPF KSQYKGMNYV MNTLLSMSMV IAFIMAVILD NTVPGSKQER GVYVWSDSET ATREPALAKD YELPFRVGRF 701: FRWVKWVGI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)