AT2G21320.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : B-box zinc finger family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
B-box zinc finger family protein; FUNCTIONS IN: sequence-specific DNA binding transcription factor activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: regulation of transcription; LOCATED IN: endomembrane system, intracellular; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, B-box (InterPro:IPR000315); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: B-box type zinc finger family protein (TAIR:AT4G38960.1); Has 1943 Blast hits to 1369 proteins in 125 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 26; Fungi - 0; Plants - 1819; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 98 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9126502..9127652 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18892.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 172 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRILCDACES AAAIVFCAAD EAALCCSCDE KVHKCNKLAS RHLRVGLADP SNAPSCDICE NAPAFFYCEI DGSSLCLQCD MVVHVGGKRT HRRFLLLRQR 101: IEFPGDKPNH ADQLGLRCQK ASSGRGQESN GNGDHDHNMI DLNSNPQRVH EPGSHNQEEG IDVNNANNHE HE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)