AT1G64890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.949 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Major facilitator superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Major facilitator superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196), Biopterin transport-related protein BT1 (InterPro:IPR004324); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Major facilitator superfamily protein (TAIR:AT1G04570.1); Has 1088 Blast hits to 1079 proteins in 365 species: Archae - 17; Bacteria - 560; Metazoa - 42; Fungi - 5; Plants - 247; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 217 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:24109752..24111165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48488.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 442 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSSSDTHAG ESRHRRNPIR WLLGFGFFVQ GFRGFPWLGA NFFLTEQLRV NPSVLQLLQN SANLPMVAKP IYGVVSDSVY FFGQHRIPYI AVGALLQAIS 101: WLAIAFLSRS NVSILALSIY LLLSNLGASL VEVANDAIVA ESGKQKTSET QSGELPSFVW MVSSLGGILG NLLGGIAIKT FSAQSTFLVF GILALLQFLV 201: TINIREKSLN LPENPSPAGG IRKHLSDLSH VLRKPEISYS IAWIAVSTAV VPVLTGTMFF YQTKFLKIDA SLLGISKVFG QIAMLLWGFA YNRWLKAMRP 301: RKLLTAIQVT IAFFVISDLL FVKGVYRDLG VSDSVYVLFF SGFLETLFYF KILPFTVLMA RLCPPGCEGS LMAFVMSAIA LAFIVSGYLG IVLASFVGVT 401: EDDFSGFTRG LAIEACCVGI PLILTSWIYD EAETKEKSKK IE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)