AT1G47710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.988 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Serine protease inhibitor (SERPIN) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Serine protease inhibitor (SERPIN) family protein; FUNCTIONS IN: serine-type endopeptidase inhibitor activity, cysteine-type endopeptidase inhibitor activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: apoplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease inhibitor I4, serpin, plant (InterPro:IPR015554), Protease inhibitor I4, serpin (InterPro:IPR000215); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Serine protease inhibitor (SERPIN) family protein (TAIR:AT3G45220.1); Has 6643 Blast hits to 6565 proteins in 500 species: Archae - 66; Bacteria - 387; Metazoa - 5142; Fungi - 12; Plants - 353; Viruses - 463; Other Eukaryotes - 220 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:17558271..17560061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42641.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 391 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDVRESISLQ NQVSMNLAKH VITTVSQNSN VIFSPASINV VLSIIAAGSA GATKDQILSF LKFSSTDQLN SFSSEIVSAV LADGSANGGP KLSVANGAWI 101: DKSLSFKPSF KQLLEDSYKA ASNQADFQSK AVEVIAEVNS WAEKETNGLI TEVLPEGSAD SMTKLIFANA LYFKGTWNEK FDESLTQEGE FHLLDGNKVT 201: APFMTSKKKQ YVSAYDGFKV LGLPYLQGQD KRQFSMYFYL PDANNGLSDL LDKIVSTPGF LDNHIPRRQV KVREFKIPKF KFSFGFDASN VLKGLGLTSP 301: FSGEEGLTEM VESPEMGKNL CVSNIFHKAC IEVNEEGTEA AAASAGVIKL RGLLMEEDEI DFVADHPFLL VVTENITGVV LFIGQVVDPL H |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)