AT1G14080.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : fucosyltransferase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Xyloglucan fucosyltransferase family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fucosyltransferase 6 (FUT6); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups, fucosyltransferase activity; INVOLVED IN: cell wall biogenesis; LOCATED IN: endomembrane system, membrane; EXPRESSED IN: stem, root, flower; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Xyloglucan fucosyltransferase (InterPro:IPR004938); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fucosyltransferase 4 (TAIR:AT2G15390.2); Has 336 Blast hits to 327 proteins in 17 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 332; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:4822580..4824218 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59038.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 519 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKILLTLVFS GLLIWSVVLV SFSNDFNNQL LVATSNVSRE SETPRDRLIG GLLTADFDEG SCLSRYQQSL LYRKASPYKP SEYLVSKLRS YEKLHKRCGP 101: GTDAYKKATE ILGHDDENYA SKSVGECRYI VWVAVYGLGN RILTLASVFL YALLTERVVL VDQSKDISDL FCEPFPGTSW LLPLEFPLMK QIDGYNKGYS 201: RCYGTMLNNQ AINSTLIPPH LYLHILHDSR DNDKMFFCQK DQSLVDKVPW LIVKANVYFV PSLWLNPTFQ TELMKLFPQK EAVFHHLARY LFHPTNQVWG 301: LITRSYNAYL SRADETLGIQ IRVFSDRAGY FQHVMDQVVA CTRRENLLPE PAAQEEPKVN ISRSQKLKAV LVTSLYPEYS ETLKNMYWER PSSTGEIIEV 401: YQPSGERVQQ TDKKLHDQKA LAEMYLLSLT DKIVTSARST FGYVAHSLGG LKPWLLYQPT GPTAPDPPCI QSTSMDPCHL TPPSHGCEPE WGTNSGKVVP 501: FVRHCEDRGN DGLKLFDEL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)