AT1G09180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.890 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : secretion-associated RAS super family 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
A member of ARF-like GTPase family. A thaliana has 21 members, in two subfamilies, ARF and ARF-like (ARL) GTPases. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
secretion-associated RAS super family 1 (SARA1A); FUNCTIONS IN: GTP binding; INVOLVED IN: intracellular protein transport; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 15 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Small GTP-binding protein (InterPro:IPR005225), Small GTPase SAR1-type (InterPro:IPR006687), ARF/SAR superfamily (InterPro:IPR006689); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: secretion-associated RAS 1B (TAIR:AT1G56330.1); Has 6779 Blast hits to 6777 proteins in 381 species: Archae - 2; Bacteria - 35; Metazoa - 3324; Fungi - 1254; Plants - 1081; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1083 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:2965147..2965941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21967.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 193 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFLFDWFYGI LASLGLCKKE AKILFLGLDN AGKTTLLHML KDERLVQHQP TQHPTSEELS IGKINFKAFD LGGHQIARRV WKDCYAKVDA VVYLVDAYDR 101: DRFVESKREL DALLSDEALA NVPCLILGNK IDIPYASSED ELRYYLGLTN FTTGKGIVNL EDSGVRPLEV FMCSIVRKMG YGEGFKWLSQ YIK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)