AT5G66380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : folate transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a folate transporter that is located in the chloroplast envelope and is able to mediate exogenous folate uptake when expressed in E. coli. However, this is not the sole folate transporter for chloroplasts as null mutants of this gene have no discernible phenotype when grown under folate-sufficient conditions and contained wild-type levels of folates in leaves. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
folate transporter 1 (FOLT1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108), Adenine nucleotide translocator 1 (InterPro:IPR002113); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD+ transporter 2 (TAIR:AT1G25380.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26513645..26515533 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34121.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 308 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAASWQWENA TAGAVAGFAT VAAMHSLDVV RTRFQVNDGR GSSLPTYKNT AHAVFTIARL EGLRGLYAGF FPAVIGSTVS WGLYFFFYGR AKQRYARGRD 101: DEKLSPALHL ASAAEAGALV CLCTNPIWLV KTRLQLQTPL HQTQPYSGLL DAFRTIVKEE GPRALYKGIV PGLVLVSHGA IQFTAYEELR KIIVDLKERR 201: RKSESTDNLL NSADYAALGG SSKVAAVLLT YPFQVIRARL QQRPSTNGIP RYIDSLHVIR ETARYEGLRG FYRGLTANLL KNVPASSITF IVYENVLKLL 301: KQHPTTKD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)