AT5G65510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : AINTEGUMENTA-like 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
AINTEGUMENTA-like 7 (AIL7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding, integrase-type (InterPro:IPR016177), Pathogenesis-related transcriptional factor/ERF, DNA-binding (InterPro:IPR001471); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: AINTEGUMENTA-like 6 (TAIR:AT5G10510.2); Has 7565 Blast hits to 5160 proteins in 254 species: Archae - 0; Bacteria - 8; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 7501; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 54 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:26185829..26189413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55450.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 498 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPPMTNCLT FSLSPMEMLK STDQSHFSSS YDDSSTPYLI DNFYAFKEEA EIEAAAASMA DSTTLSTFFD HSQTQIPKLE DFLGDSFVRY SDNQTETQDS 101: SSLTPFYDPR HRTVAEGVTG FFSDHHQPDF KTINSGPEIF DDSTTSNIGG THLSSHVVES STTAKLGFNG DCTTTGGVLS LGVNNTSDQP LSCNNGERGG 201: NSNKKKTVSK KETSDDSKKK IVETLGQRTS IYRGVTRHRW TGRYEAHLWD NSCRREGQAR KGRQVYLGGY DKEDRAARAY DLAALKYWGS TATTNFPVSS 301: YSKELEEMNH MTKQEFIASL RRKSSGFSRG ASIYRGVTRH HQQGRWQARI GRVAGNKDLY LGTFATEEEA AEAYDIAAIK FRGINAVTNF EMNRYDIEAV 401: MNSSLPVGGA AAKRHKLKLA LESPSSSSSD HNLQQQQLLP SSSPSDQNPN SIPCGIPFEP SVLYYHQNFF QHYPLVSDST IQAPMNQAEF FLWPNQSY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)