AT5G62980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Dihydroneopterin aldolase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an enzyme that can act as a aldolase or an epimerase for 7,8-dihydroneopterin and 7,8-dihydromonapterin in vitro. It is likely to act in folate biosynthesis as a homooctamer in vivo. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FOLB2; FUNCTIONS IN: dihydroneopterin aldolase activity; INVOLVED IN: folic acid and derivative metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dihydroneopterin aldolase (InterPro:IPR006157), Dihydroneopterin aldolase subgroup (InterPro:IPR006156); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dihydroneopterin aldolase (TAIR:AT3G11750.1); Has 2737 Blast hits to 2737 proteins in 1212 species: Archae - 4; Bacteria - 2338; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 88; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 307 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25276384..25277083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14686.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 131 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKDMAMMGD KLILRGLKFY GFHGAIPEEK TLGQMFMLDI DAWMCLKKAG LSDNLADSVS YVDIYNVAKE VVEGSSRNLL ERVAGLIASK TLEISPRITA 101: VRVKLWKPNV ALIQSTIDYL GVEIFRDRAT E |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)