AT5G58240.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : FRAGILE HISTIDINE TRIAD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a Fhit protein. Has nucleoside phosphoramidase and adenylylsulfatase activities. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FRAGILE HISTIDINE TRIAD (FHIT); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histidine triad-like motif (InterPro:IPR011146), Histidine triad, conserved site (InterPro:IPR019808), Histidine triad (HIT) protein (InterPro:IPR001310), Histidine triad motif (InterPro:IPR011151); Has 5210 Blast hits to 5210 proteins in 1676 species: Archae - 233; Bacteria - 3245; Metazoa - 250; Fungi - 213; Plants - 74; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1193 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:23558349..23559313 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20401.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 180 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLNLQVTGKT ILSSIRCQRK MSSTCSSYAF GPYKIDPREV FYATPLSYAM VNLRPLLPAH VLVCPRRLVP RFTDLTADET SDLWLTAQKV GSKLETFHNA 101: SSLTLAIQDG PQAGQTVPHV HIHILPRKGG DFEKNDEIYD ALDEKEKELK QKLDLDKDRV DRSIQEMADE ASQYRSLFDC |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)