AT5G57140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.690 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 28 (PAP28); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, acid phosphatase activity; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Phosphoesterase At2g46880 (InterPro:IPR011230); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 29 (TAIR:AT5G63140.1); Has 678 Blast hits to 661 proteins in 227 species: Archae - 0; Bacteria - 324; Metazoa - 0; Fungi - 205; Plants - 115; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 34 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:23149926..23151370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45439.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 397 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNCSIGNWKH TVLYLTLIVS LLYFIESLIS HKLHINYNKI RLKRSPNLPL RFRDDGTFKI LQVADMHFGM GMITRCRDVL DSEFEYCSDL NTTRFLRRMI 101: ESERPDLIAF TGDNIFGSST TDAAESLLEA IGPAIEYGIP WAAVLGNHDH ESTLNRLELM TFLSLMDFSV SQINPLVEDE TKGDTMRLID GFGNYRVRVY 201: GAPGSVLANS TVFDLFFFDS GDREIVQGKR TYGWIKESQL RWLQDTSIQG HSQRIHVNPP ALAFFHIPIL EVRELWYTPF IGQFQEGVAC SIVQSGVLQT 301: FVSMGNVKAA FMGHDHVNDF CGTLKGVWFC YGGGFGYHAY GRPNWHRRAR VIEAKLGKGR DTWEGIKLIK TWKRLDDEYL SKIDEQVLWE TSDSFLK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)