AT5G43600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ureidoglycolate amidohydrolase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with ureidoglycolate amidohydrolase activity in vitro. It is 27% identical and 43% similar to the E. coli allantoate amidohydrolase (AAH), but, in vitro assays with purified protein and allantoate as a substrate do not show any increase in ammonium concentration, indicating that there this enzyme has no AAH activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ureidoglycolate amidohydrolase (UAH); FUNCTIONS IN: metallopeptidase activity, ureidoglycolate hydrolase activity; INVOLVED IN: proteolysis, allantoin catabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M20 (InterPro:IPR002933), Amidase, hydantoinase/carbamoylase (InterPro:IPR010158), Peptidase M20, dimerisation (InterPro:IPR011650); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: allantoate amidohydrolase (TAIR:AT4G20070.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:17512651..17515280 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51489.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 476 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESLKRFLCS IALLLISLLL PSSLAQQQQH ESIRTMEDFS GYPIHEPGQF GSINLASSLS VDAPGLQNQI DELSSFSDAP SPSVTRVLYT DKDVSARRYV 101: KNLMALAGLT VREDAVGNIF GKWDGLEPNL PAVATGSHID AIPYSGKYDG VVGVLGAIEA INVLKRSGFK PKRSLEIILF TSEEPTRFGI SCLGSRLLAG 201: SKELAEALKT TVVDGQNVSF IEAARSAGYA EDKDDDLSSV FLKKGSYFAF LELHIEQGPI LEDEGLDIGV VTAIAAPASL KVEFEGNGGH AGAVLMPYRN 301: DAGLAAAELA LAVEKHVLES ESIDTVGTVG ILELHPGAIN SIPSKSHLEI DTRDIDEARR NTVIKKIQES ANTIAKKRKV KLSEFKIVNQ DPPALSDKLV 401: IKKMAEAATE LNLSHKMMIS RAYHDSLFMA RISPMGMIFI PCYKGYSHKP EEYSSPEDMA NGVKVLSLTL AKLSLD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)