AT5G37830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : oxoprolinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a 5-oxoprolinase that acts in the glutathione degradation pathway and in 5-oxoproline metabolism. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
oxoprolinase 1 (OXP1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Hydantoinase B/oxoprolinase (InterPro:IPR003692), Hydantoinase/oxoprolinase (InterPro:IPR002821), Hydantoinaseoxoprolinase, N-terminal (InterPro:IPR008040); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:15056635..15060525 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 137539.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1266 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MGTVIEGKLR FCIDRGGTFT DVYAEIPGHS DGHVLKLLSV DPSNYDDAPV EGIRRILEEY TGKKIPRTSK IPTDKIQWIR MGTTVATNAL LERKGERIAL 0101: CVTKGFKDLL QIGNQARPDI FDLTVAKPSN LYEEVIEVDE RVVLALEDDD DDEGSLIKGV SGEFLRVVKP FDGEGLKPLL KGLLDKGISC LAVVLMHSYT 0201: YPKHEMDVEK LALEMGFRHV SLSSALTPMV RAVPRGLTAT VDAYLTPVIK EYLSGFISKF DDDLGKVNVL FMQSDGGLAP ESRFSGHKAV LSGPAGGVVG 0301: YSQTLFGLET EKPLIGFDMG GTSTDVSRYD GSYEQVIETQ IAGTIIQAPQ LDINTVAAGG GSKLKFQFGA FRVGPDSVGA HPGPVCYRKG GELAVTDANL 0401: VLGFVIPDYF PSIFGPNEDQ PLDVAATREA FEKLAGQINI YRKSQDPSAK DMSVEEIAMG FVSVANETMC RPIRQLTEMK GHETKNHALA CFGGAGPQHA 0501: CAIARSLGMK EVLVHRYCGI LSAYGMGLAD VIEDAQEPYS AVYGPESLSE VFRRETVLLR EVREKLQEQG FGDGNISTET YLNLRYDGTD TAIMVKGKKT 0601: GDGSAFDYAA EFLKLFEQEY GFKLQNRNLL ICDVRVRGIG VTSILKPRAV EAAPVTPKVE RHYKVYFEGG WHDTPLFKLE NLGFGHEILG PAIIMNGNST 0701: VIVEPQCKAI ITKYGNIKIE VEPATSSVKL AENVADVVQL SIFNHRFMGI AEQMGRTLQR TSISTNIKER LDFSCALFSP DGGLVANAPH VPVHLGAMSS 0801: TVRWQLKHWG ENLNEGDVLV TNHPCAGGSH LPDITVITPV FDKGKLVFFV ASRGHHAEVG GITPGSMPPF SKAIWEEGAA IKAFKVVEKG VFQEEGIVKL 0901: LQFPSSDETT TKIPGTRRIQ DNLSDLQAQI AANQRGISLI KELIEQYGLG TVQAYMKYVQ LNAEEAVREM LKSVANRVSS ETPNSRVGNS VTIEEEDYMD 1001: DGSIIHLKLT IDADKGEASF DFTGTSPEVY GNWNAPEAVT SAAVIYCLRC LVNVDIPLNQ GCLAPVEIRI PAGSFLSPSE KAAVVGGNVL TSQRVTDVVL 1101: TAFQACACSQ GCMNNLTFGD DTFGYYETIG GGCGAGPTWN GTSGVQCHMT NTRMTDPEIF EQRYPVLLHR FGLRENSGGN GLHKGGDGLV REIEFRKPVV 1201: VSILSERRVH SPRGLNGGQN GLRGANYLIT KDKRRIYLGG KNTVHVEAGE ILQILTPGGG GFGSNI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)