AT5G13750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : zinc induced facilitator-like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
zinc induced facilitator-like 1 (ZIFL1); FUNCTIONS IN: tetracycline:hydrogen antiporter activity; INVOLVED IN: response to karrikin; LOCATED IN: integral to membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), Tetracycline resistance protein, TetA (InterPro:IPR001958), Major facilitator superfamily MFS-1 (InterPro:IPR011701), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: zinc induced facilitator 1 (TAIR:AT5G13740.1); Has 19294 Blast hits to 18859 proteins in 2587 species: Archae - 361; Bacteria - 14367; Metazoa - 620; Fungi - 2172; Plants - 389; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1385 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:4438318..4441289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52302.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 478 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEEYAECLL EKNFHEDCSG CKVDQMKRLR RGFPFWELFT VWIIVLCTAL PISSLFPFLY FMIDDFNIAK KEEDIGFYAG FVGCSFMLGR AFTSVAWGLV 101: ADRYGRKPVI LIGTASVVVF NTLFGLSLNF WMAIITRFCL GSFNGLLGPI KAYAMEIFRD EYQGLALSAV STAWGIGLII GPAIGGFLAQ PAKQYPSLFS 201: QDSIFGKFPF FLPCLAISVF AFLVTIVSSR IPETLHNHKF NDDESYDALK DLSDDPESNK VAERNGKSSL LNNWPLISSI IVYCVFSLHD MAYTEIFSLW 301: ANSPRKYGGL GYSTADVGSV LAFSGFGLLI FQLSLYSYAE RLLGPIIVTR ISGSLAMVVL SCYPLIAKLS GLALTVTVTS ASVAKSVLGT SAITGLFILQ 401: NKAVRQDQRG AANGIAMTAM SLFKAIGPAA AGIIFSWSEK RQGAAFLPGT QMVFFILNVV LALGVVLTFK PFLAETQQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)