AT3G53160.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.779 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 73C7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 73C7 (UGT73C7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT2G36770.1); Has 7083 Blast hits to 7007 proteins in 427 species: Archae - 0; Bacteria - 435; Metazoa - 1539; Fungi - 21; Plants - 4999; Viruses - 33; Other Eukaryotes - 56 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19702485..19703957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54573.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 490 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCSHDPLHFV VIPFMAQGHM IPLVDISRLL SQRQGVTVCI ITTTQNVAKI KTSLSFSSLF ATINIVEVKF LSQQTGLPEG CESLDMLASM GDMVKFFDAA 101: NSLEEQVEKA MEEMVQPRPS CIIGDMSLPF TSRLAKKFKI PKLIFHGFSC FSLMSIQVVR ESGILKMIES NDEYFDLPGL PDKVEFTKPQ VSVLQPVEGN 201: MKESTAKIIE ADNDSYGVIV NTFEELEVDY AREYRKARAG KVWCVGPVSL CNRLGLDKAK RGDKASIGQD QCLQWLDSQE TGSVLYVCLG SLCNLPLAQL 301: KELGLGLEAS NKPFIWVIRE WGKYGDLANW MQQSGFEERI KDRGLVIKGW APQVFILSHA SIGGFLTHCG WNSTLEGITA GVPLLTWPLF AEQFLNEKLV 401: VQILKAGLKI GVEKLMKYGK EEEIGAMVSR ECVRKAVDEL MGDSEEAEER RRKVTELSDL ANKALEKGGS SDSNITLLIQ DIMEQSQNQF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)