AT4G36760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aminopeptidase P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Arabidopsis aminopeptidase P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aminopeptidase P1 (APP1); FUNCTIONS IN: aminopeptidase activity, N-1-naphthylphthalamic acid binding; INVOLVED IN: auxin polar transport; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase P, conserved site (InterPro:IPR001131), Peptidase M24, structural domain (InterPro:IPR000994), Creatinase (InterPro:IPR000587); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Metallopeptidase M24 family protein (TAIR:AT3G05350.1); Has 10398 Blast hits to 10335 proteins in 2401 species: Archae - 277; Bacteria - 6310; Metazoa - 362; Fungi - 246; Plants - 146; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3057 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:17326688..17329979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71996.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 645 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSEILSSLRS LMASHSPPLD ALVVPSEDYH QSEYVSARDK RREFVSGFSG SAGLALITKK EARLWTDGRY FLQALQQLSD EWTLMRMGED PLVEVWMSDN 101: LPEEANIGVD SWCVSVDTAN RWGKSFAKKN QKLITTTTDL VDEVWKSRPP SEMSPVVVHP LEFAGRSVSH KFEDLRAKLK QEGARGLVIA ALDEVAWLYN 201: IRGTDVAYCP VVHAFAILTT DSAFLYVDKK KVSDEANSYF NGLGVEVREY TDVISDVALL ASDRLISSFA SKTVQHEAAK DMEIDSDQPD RLWVDPASCC 301: YALYSKLDAE KVLLQPSPIS LSKALKNPVE LEGIKNAHVR DGAAVVQYLV WLDNQMQELY GASGYFLEAE ASKKKPSETS KLTEVTVSDK LESLRASKEH 401: FRGLSFPTIS SVGSNAAVIH YSPEPEACAE MDPDKIYLCD SGAQYLDGTT DITRTVHFGK PSAHEKECYT AVFKGHVALG NARFPKGTNG YTLDILARAP 501: LWKYGLDYRH GTGHGVGSYL CVHEGPHQVS FRPSARNVPL QATMTVTDEP GYYEDGNFGI RLENVLVVND AETEFNFGDK GYLQFEHITW APYQVKLIDL 601: DELTREEIDW LNTYHSKCKD ILAPFMNQTE MEWLKKATEP VSVSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)