AT4G35110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Arabidopsis phospholipase-like protein (PEARLI 4) family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Arabidopsis phospholipase-like protein (PEARLI 4) family; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipase-like, arabidopsis (InterPro:IPR007942); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Arabidopsis phospholipase-like protein (PEARLI 4) family (TAIR:AT2G16900.1); Has 682 Blast hits to 587 proteins in 127 species: Archae - 27; Bacteria - 57; Metazoa - 143; Fungi - 39; Plants - 275; Viruses - 32; Other Eukaryotes - 109 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:16712660..16713987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43258.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 386 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDFNRKAHPD CVYADNPFHE CASACLEKIA QGHVKKNTKK QSSRLLSFSG SFGRKKKESN SQPPTPLSAR PYQNGRGGFA NGNSPKVHHS VAPPASVKKK 101: IVSETKNSFT SSSSGDPDDF FNHKPEKKPS QTIPLSSNNL VDQSKVVSPK PGIQEHNGKI GEGGETRLFS FLSLPRSPGK ESNDDFSDDD DENNNEIGVE 201: LDLESVMSDT FVSVGKYRVR SGSSTILSAV IEKHGDIAQN CKLESDSMRS RYLECLCSLM QELRSTPVGQ LSKVKVKEML AVLKDLESVN IEVAWLRSVL 301: EEFAQSQEDV ENEKERHDGL VKAKREELEA QETDLVRMEK EVVEVKRRIE ETRAQMVEIE AERLRMEKMG FKMEKFKGKS FIDELL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)