AT4G32175.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.794 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : PNAS-3 related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PNAS-3 related; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PNAS-3 related (TAIR:AT2G25355.1); Has 535 Blast hits to 535 proteins in 248 species: Archae - 104; Bacteria - 0; Metazoa - 113; Fungi - 163; Plants - 59; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 96 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15535555..15537537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26219.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 241 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAKVSVSPT SLLNQIVVPG DVVLDLSNMN NQTIKLGSGL LQDNDAISAM RAGKLSYSKP NKYWLESSHK RYIPRPDDHV LGIVVDSRAD NFWVDIKGPQ 101: LALLPVLAFE GGTRRNIPKF EVGTLLYLRV VKTNIGMNPE LSCTEASGKA ALFGPLRDGF MFETSTGLSR MLLNSPTRPV IEALGKKLSF EIAVGLNGRV 201: WVNATAPRIV IIVANAIMNS ESLSGTQQRI MVEKLLAIIS D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)