AT4G26760.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:nucleus 0.998 ASURE: cytoskeleton What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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FP Images |
7-day old Arabidopsis seedling (no marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : microtubule-associated protein 65-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
microtubule-associated protein 65-2 (MAP65-2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Microtubule-associated protein, MAP65/ASE1-type (InterPro:IPR007145); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: microtubule-associated proteins 65-1 (TAIR:AT5G55230.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13478834..13481300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 65208.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 4.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 578 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVTEAENPL LGEITCGTLL QKLQEIWDEV GESDEERDKL LLQIEEECLN VYKKKVELAA KSRAELLQTL SDATVELSNL TTALGEKSYI DIPDKTSGTI 101: KEQLSAIAPA LEQLWQQKEE RVRAFSDVQS QIQKICEEIA GGLNNGPHVV DETDLSLKRL DDFQRKLQEL QKEKSDRLQK VLEFVSTVHD LCAVLRLDFL 201: STVTEVHPSL DEANGVQTKS ISNETLARLA KTVLTLKEDK MQRLKKLQEL ATQLTDLWNL MDTSDEEREL FDHVTSNISA SVHEVTASGA LALDLIEQAE 301: VEVDRLDQLK SSRMKEIAFK KQSELEEIYA RAHIEIKPEV VRERIMSLID AGNTEPTELL ADMDSQIAKA KEEAFSRKEI LDRVEKWMSA CEEESWLEDY 401: NRDQNRYSAS RGAHLNLKRA EKARILVSKI TAMVDTLIAK TRAWEEENSM SFEYDGVPLL AMLDEYTMLR QEREDEKRRL KEQKKQQEQP HTDQESAFGS 501: KPSPARPVSA KKPVGTRVNG GGLNETPMRR LSMNSNQNGS KSKRDSLNKI ASPSNIVANT KDDAASPVSR ADPVMASP |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)