AT4G21230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 27 (CRK27); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: hypocotyl, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 26 (TAIR:AT4G38830.1); Has 120175 Blast hits to 118702 proteins in 4414 species: Archae - 114; Bacteria - 13808; Metazoa - 44281; Fungi - 10127; Plants - 33876; Viruses - 432; Other Eukaryotes - 17537 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:11319244..11321679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71939.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 642 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASTSIMLSS FFSFFFLTFF VTYAQQNVTV HTICYYDGGN FTSNTSYSLN LNRLISSLPD LTPTINGFYN ISINGEVNAI ALCRGDVKPN QDCISCITTA 101: AKQLVESCPN IIEANIWLEK CMFRYTSRII LGQMEPVPFS YTSSNVSVTD KEGFSKGLGD LLDSLGAKID AANETKEVKF AAGVKGTIYA LAQCTPDLSE 201: SDCRICLAQI FAGVPTCCDG KTGGWWTNPS CYFRFEVYPF FDLSVTSEQK QPLSSHNNNT RRSDQGKSKD RSKTLIFAVV PIVAIILGLV FLFIYLKRRR 301: KKKTLKENAE NEFESTDSLH FDFETIRVAT DDFSLTNKIG EGGFGVVYKG HLPDGLEIAV KRLSIHSGQG NAEFKTEVLL MTKLQHKNLV KLFGFSIKES 401: ERLLVYEFIP NTSLDRFLFD PIKQKQLDWE KRYNIIVGVS RGLLYLHEGS EFPIIHRDLK SSNVLLDEQM LPKISDFGMA RQFDFDNTQA VTRRVVGTYG 501: YMAPEYAMHG RFSVKTDVYS FGVLVLEIIT GKRNSGLGLG EGTDLPTFAW QNWIEGTSME LIDPVLLQTH DKKESMQCLE IALSCVQENP TKRPTMDSVV 601: SMLSSDSESR QLPKPSQPGF FRRSASFSIS LNDVSLTDLS AR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)