AT4G15802.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : heat shock factor binding protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with similarity to heat shock factor binding proteins. Involved in negative regulation of heat shock response. Becomes nuclear localized upon heat treatment. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
heat shock factor binding protein (HSBP); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Heat shock factor binding 1 (InterPro:IPR009643); Has 319 Blast hits to 319 proteins in 108 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 183; Fungi - 14; Plants - 74; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 48 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8986864..8988339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 9347.79 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 86 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MDGHDSEDTK QSTADMTAFV QNLLQQMQTR FQTMSDSIIT KIDDMGGRIN ELEQSINDLR AEMGVEGTPP PASKSGDEPK TPASSS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)