AT4G11910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: non-yellowing 1 (TAIR:AT4G22920.1); Has 206 Blast hits to 202 proteins in 67 species: Archae - 0; Bacteria - 86; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 118; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:7156435..7157839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30754.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 271 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCSLATNLLL PSKMKPVFPE KLSTSSLCVT TRRSKMKNRS IVPVARLFGP AIFEASKLKV LFLGVDEKKH PAKLPRTYTL THSDITAKLT LAISQSINNS 101: QLQGWANKLF RDEVVGEWKK VKGKMSLHVH CHISGGHFFL NLIAKLRYYI FCKELPVVLE AFAHGDEYLL NNHPELQESP VWVYFHSNIP EYNKVECWGP 201: LWEAMSQHQH DGRTHKKSET LPELPCPDEC KCCFPTVSTI PWSHRHYQHT AADENVADGL LEIPNPGKSK G |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)