AT4G09030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arabinogalactan protein 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes arabinogalactan protein (AGP10). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
arabinogalactan protein 10 (AGP10); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: arabinogalactan protein 5 (TAIR:AT1G35230.1); Has 48976 Blast hits to 22309 proteins in 1360 species: Archae - 353; Bacteria - 13758; Metazoa - 10045; Fungi - 3818; Plants - 7001; Viruses - 1838; Other Eukaryotes - 12163 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:5792249..5792632 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12071.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 127 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASKSVVVLL FLALIASSAI AQAPGPAPTR SPLPSPAQPP RTAAPTPSIT PTPTPTPSAT PTAAPVSPPA GSPLPSSASP PAPPTSLTPD GAPVAGPTGS 101: TPVDNNNAAT LAAGSLAGFV FVASLLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)