AT4G05110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : equilibrative nucleoside transporter 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
equilibrative nucleoside transporter 6 (ENT6); FUNCTIONS IN: nucleoside transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transport; LOCATED IN: plasma membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter (InterPro:IPR002259); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Major facilitator superfamily protein (TAIR:AT4G05120.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:2626516..2628685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46228.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 418 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADIYEHQVP EKLRGKYQAM IVYCILGFGS LISWNSMLTT ADYYYKVFPD YHPSRVLTLV YQPFAFGAIV ILAYHESKTS TRKRNLIGYI LYTISTFLLI 101: VLDLATKGRG GFGPYTGLCA VVAAFGLADA TVQGGMFGDL SLMCPELVQS YMGGMAVAGA LTSALRLITK AAFEKSNNGL RKGAMMFLAI STCIELLSVM 201: LYAYVLPKLP IVMYYRRKAA SQGSKTVSAD LAAAGIQNQS DLSDDDSKNQ RLSKKELLFQ NIDHAVNLFL IYVCTLSIFP GFLYENTGQH GLGAWYALVL 301: VAMYNCWDLV GRYTPLVKWL NIENRKLITI AVLSRYLLIP AFYFTAKYGD QGWMIMLVSV LGLTNGHLTV CIMTIAPKGY KGPEQNALGN LLVIFLLGGI 401: FAGVALDWLW LIGKKNAF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)