AT4G04610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : APS reductase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein disulfide isomerase-like (PDIL) protein, a member of a multigene family within the thioredoxin (TRX) superfamily. This protein also belongs to the adenosine 5'-phosphosulfate reductase-like (APRL) group. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
APS reductase 1 (APR1); FUNCTIONS IN: adenylyl-sulfate reductase activity; INVOLVED IN: response to oxidative stress, sulfate reduction, sulfate assimilation; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast stroma, plastid; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Thioredoxin-independent 5'-adenylylsulphate reductase (InterPro:IPR004508), Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Phosphoadenosine phosphosulphate reductase (InterPro:IPR002500), Thioredoxin-like (InterPro:IPR017936), Thioredoxin domain (InterPro:IPR013766), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: APS reductase 3 (TAIR:AT4G21990.1); Has 5999 Blast hits to 5419 proteins in 1658 species: Archae - 169; Bacteria - 2693; Metazoa - 1288; Fungi - 563; Plants - 600; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 686 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:2325069..2326718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51716.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 465 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMSVNVSSS SSSGIINSRF GVSLEPKVSQ IGSLRLLDRV HVAPVSLNLS GKRSSSVKPL NAEPKTKDSM IPLAATMVAE IAEEVEVVEI EDFEELAKKL 101: ENASPLEIMD KALEKYGNDI AIAFSGAEDV ALIEYAHLTG RPFRVFSLDT GRLNPETYRF FDAVEKHYGI RIEYMFPDSV EVQGLVRSKG LFSFYEDGHQ 201: ECCRVRKVRP LRRALKGLKA WITGQRKDQS PGTRSEIPVV QVDPVFEGLD GGVGSLVKWN PVANVEGNDV WNFLRTMDVP VNTLHAAGYI SIGCEPCTKA 301: VLPGQHEREG RWWWEDAKAK ECGLHKGNVK ENSDDAKVNG ESKSAVADIF KSENLVTLSR QGIENLMKLE NRKEPWIVVL YAPWCPFCQA MEASYDELAD 401: KLAGSGIKVA KFRADGDQKE FAKQELQLGS FPTILVFPKN SSRPIKYPSE KRDVESLTSF LNLVR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)