AT4G04540.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.971 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 39 (CRK39); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 40 (TAIR:AT4G04570.1); Has 125664 Blast hits to 124100 proteins in 4695 species: Archae - 110; Bacteria - 14484; Metazoa - 46060; Fungi - 11047; Plants - 34830; Viruses - 446; Other Eukaryotes - 18687 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:2259580..2262138 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73572.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 659 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKYSVLMIF IASSLLIVLQ NVEIVNAVGC TGSFFNGNSS YAQNRRDLFS TLPNKVVTNG GFYNSSLGKS PNIVHAVALC GRGYEQQACI RCVDSAIQGI 101: LTTTSCLNRV DSFTWDKDEE DNVSCLVSTS NHSTFGNLEL RPSVRYQSPN SIEPSKNMTL FEQEWNAMAN RTVESATEAE TSSVLKYYSA EKAEFTEFPN 201: VYMLMQCTPD ITSQDCKTCL GECVTLFKEQ VWGRQGGEVY RPSCFFRWDL YAFHGAFDNV TRVPAPPRPQ AQGNESSITK KKGRSIGYGG IIAIVVVLTF 301: INILVFIGYI KVYGRRKESY NKINVGSAEY SDSDGQFMLR FDLGMVLAAT DEFSSENTLG QGGFGTVYKG TLLNGQEVAV KRLTKGSGQG DIEFKNEVSL 401: LTRLQHRNLV KLLGFCNEGD EQILVYEFVP NSSLDHFIFD DEKRSLLTWE MRYRIIEGIA RGLLYLHEDS QLKIIHRDLK ASNILLDAEM NPKVADFGTA 501: RLFDSDETRA ETKRIAGTRG YMAPEYLNHG QISAKSDVYS FGVMLLEMIS GERNNSFEGE GLAAFAWKRW VEGKPEIIID PFLIEKPRNE IIKLIQIGLL 601: CVQENPTKRP TMSSVIIWLG SETNIIPLPK APAFTGSRSQ SEIGAMSMSD DVFTELSCR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)