AT3G47300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.959 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : SELT-like protein precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
SELT-like protein precursor (SELT); FUNCTIONS IN: selenium binding; INVOLVED IN: cell redox homeostasis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Selenoprotein T (InterPro:IPR019389), Selenoprotein, Rdx type (InterPro:IPR011893); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Selenoprotein, Rdx type (TAIR:AT5G58640.1); Has 232 Blast hits to 232 proteins in 72 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 131; Fungi - 0; Plants - 78; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 21 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:17428685..17429555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22652.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 209 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDKTQLILLG LPIFLLCSDL FNLFTPPPPK SQHQSPPSIS ETLDFPAQKS TGVGYGNTVE INFCISCSYK GTAVSMKKML ESVFPGLDVV LANYPAPAPK 101: RILAKVVPVA QVGVIGLIMG GEQIFPMIGI AQPPAWYHSL RANRFGSMAS TWLLGNFLQS FLQSSGAFEV SCNGELVFSK LKEGRFPGEI ELRDLISGTM 201: TKPFVTGSY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)