AT3G44550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.876 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fatty acid reductase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the eight-member gene family encoding alcohol-forming fatty acyl-CoA reductases (FARs) identified in Arabidopsis thaliana. Three of the FARs, FAR1 (At5g22500), FAR4 (At3g44540) and FAR5 (At3g44550), are shown to generate the fatty alcohols found in root, seed coat, and wound-induced leaf tissue. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fatty acid reductase 5 (FAR5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Male sterility (InterPro:IPR004262), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Male sterility, NAD-binding (InterPro:IPR013120); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fatty acid reductase 8 (TAIR:AT3G44560.1); Has 2710 Blast hits to 2672 proteins in 523 species: Archae - 2; Bacteria - 816; Metazoa - 1013; Fungi - 330; Plants - 287; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 262 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:16138060..16141409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56432.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 496 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELNCVQFLR NKTILVTGAT GFLAKVFVEK ILRVQPNVKK LYLLVRASDN EAATKRLRTE VFEKELFKVL RQNLGDEKLN TLLYEKVVSV PGDIATDQLG 101: INDSHLRERM QKEIDIVVNV AATTNFDERY DVGLGINTFG ALNVLNFAKK CVKVQLLLHV STAYVCGEKP GLIPEKPFIM EEIRNENGLQ LDINLERELM 201: KQRLKELNEQ DCSEEDITLS MKELGMERAK LHGWPNTYVF TKSMGEMLLG KHKENLPLVI IRPTMITSTL SEPFPGWIEG LRTVDSVIIA YGKGVLKCFL 301: VDVNSVCDMI PVDMVANAMI TAAAKHAGGS GVHMVYHVGS SHQNPVTFGE IHEIAVRYFT KNPLRSRNGS LITVSKVRFI PTMALFSLYM TLRYKLPLQL 401: LKLVDIIYPW RNGDKYGDKN RKIELVMRLV ELYEPYVLFK GIFDDRNTKS LCANQKEEEI KNTEKLMFDF DPKGINWGDY LTNIHISGLV THVLKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)