AT3G13120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S10p/S20e family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein S10p/S20e family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome, RNA binding; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: small ribosomal subunit, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S10 subgroup (InterPro:IPR005731), Ribosomal protein S10, conserved site (InterPro:IPR018268), Ribosomal protein S10 (InterPro:IPR001848); Has 8443 Blast hits to 8443 proteins in 2902 species: Archae - 264; Bacteria - 5393; Metazoa - 337; Fungi - 182; Plants - 190; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2077 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:4220310..4221526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20838.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 191 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVSTVSSFL LPSFGIPSSS PSSTRLKVSL LPSSSTHGGL SSCVLTKPSV SLTKVFAVPD TLDPTPEILD EPASEVPSSS SISVDADKMA PKQKIRIKLR 101: SYWVPLIEDS CKQILDAARN TNAKTMGPVP LPTKKRIYCV LKSPHVHKDA RFHFEIRTHQ RMIDILYPTA QTIDSLMQLD LPAGVDVEVK L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)