AT3G10140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RECA homolog 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
RECA homolog 3 (RECA3); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: DNA repair, SOS response, DNA recombination, DNA metabolic process; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA recombination/repair protein RecA/RadB, ATP-binding domain (InterPro:IPR020588), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), DNA recombination and repair protein RecA (InterPro:IPR013765), DNA recombination/repair protein RecA, monomer-monomer interface (InterPro:IPR020587); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: recA DNA recombination family protein (TAIR:AT2G19490.1); Has 19406 Blast hits to 19280 proteins in 5632 species: Archae - 329; Bacteria - 14407; Metazoa - 165; Fungi - 231; Plants - 211; Viruses - 99; Other Eukaryotes - 3964 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:3134984..3137069 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42956.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 389 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRLSWASPI QRFRFFSYLS QLNGRRSVLA CSGYENRYLS SLVEASDCEL DEVPDDRKVA EKDTALHLAL SQLSGDFDKD SKLSLQRFYR KRRVSVISTG 101: SLNLDLALGV GGLPKGRMVE VYGKEASGKT TLALHIIKEA QKLGGYCAYL DAENAMDPSL AESIGVNTEE LLISRPSSAE KMLNIVDVLT KSGSVDVIVV 201: DSVAALAPQC ELDAPVGERY RDTQSRIMTQ ALRKIHYSVG YSQTLIVFLN QVRSHVKSNM HFPHAEEVTC GGNALPFHAA IRLKMIRTGL IKTANKISGL 301: NVCVQVVKNK LAPGKKKSEL GIHFGHGFYV EREVLELACE HGVILREGTS YFIEGEVIEG KDAAEKYLVE NKEALDTVVA ILRNQLFKM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)