AT3G06310.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : Cox19-like CHCH family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
Cox19-like CHCH family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CHCH (InterPro:IPR010625); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cox19-like CHCH family protein (TAIR:AT5G18800.2); Has 415 Blast hits to 415 proteins in 157 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 232; Fungi - 109; Plants - 65; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr3:-:1913260..1914174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 12160.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 7.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 108 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEANAAVDGT GNPIPTSAVL TASAKHIGIR CMPENMAFLK CKKNDPNPEK CLEKGRDVTR CVLGLLKDLH QRCPKEMDAY VGCMYYYTNE FELCRKEQEA 101: FEKVCPLK |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)