AT3G02050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : K+ uptake transporter 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
potassium transporter KUP3p (KUP3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
K+ uptake transporter 3 (KUP3); FUNCTIONS IN: potassium ion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: potassium ion transport, response to external stimulus; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Potassium uptake protein, kup (InterPro:IPR018519), K+ potassium transporter (InterPro:IPR003855); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Potassium transporter family protein (TAIR:AT4G23640.1); Has 3477 Blast hits to 3392 proteins in 1029 species: Archae - 13; Bacteria - 2401; Metazoa - 1; Fungi - 102; Plants - 838; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 118 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:350815..354135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 87416.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 789 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPAESGVSP RRNPSQLSWM NLSSNLILAY QSFGVVYGDL STSPLYVFPS TFIGKLHKHH NEDAVFGAFS LIFWTLTLIP LLKYLLVLLS ADDNGEGGTF 101: ALYSLLCRHA KLSLLPNQQA ADEELSAYKF GPSTDTVTSS PFRTFLEKHK RLRTALLLVV LFGAAMVIGD GVLTPALSVL SSLSGLQATE KNVTDGELLV 201: LACVILVGLF ALQHCGTHRV AFMFAPIVII WLISIFFIGL YNIIRWNPKI IHAVSPLYII KFFRVTGQDG WISLGGVLLS VTGTEAMFAN LGHFTSVSIR 301: VAFAVVVYPC LVVQYMGQAA FLSKNLGSIP NSFYDSVPDP VFWPVFVIAT LAAIVGSQAV ITTTFSIIKQ CHALGCFPRI KVVHTSKHIY GQIYIPEINW 401: ILMILTLAMA IGFRDTTLIG NAYGIACMVV MFITTFFMAL VIVVVWQKSC FLAALFLGTL WIIEGVYLSA ALMKVTEGGW VPFVLTFIFM IAMYVWHYGT 501: RRKYSFDLHN KVSLKWLLGL GPSLGIVRVP GIGLVYSELA TGVPAIFSHF VTNLPAFHKV VVFVCVKSVP VPHVSPEERF LIGRVCPKPY RMYRCIVRYG 601: YKDIQREDGD FENQLVQSIA EFIQMEASDL QSSASESQSN DGRMAVLSSQ KSLSNSILTV SEVEEIDYAD PTIQSSKSMT LQSLRSVYED EYPQGQVRRR 701: HVRFQLTASS GGMGSSVREE LMDLIRAKEA GVAYIMGHSY VKSRKSSSWL KKMAIDIGYS FLRKNCRGPA VALNIPHISL IEVGMIYYV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)