AT3G01390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vacuolar membrane ATPase 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Subunit G of the vacuolar membrane ATPAse complex | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
vacuolar membrane ATPase 10 (VMA10); FUNCTIONS IN: hydrogen ion transporting ATP synthase activity, rotational mechanism; INVOLVED IN: ATP hydrolysis coupled proton transport; LOCATED IN: plasma membrane, proton-transporting two-sector ATPase complex, vacuole, plant-type vacuole; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Vacuolar (H+)-ATPase G subunit (InterPro:IPR005124); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: vacuolar ATP synthase subunit G2 (TAIR:AT4G23710.1); Has 617 Blast hits to 615 proteins in 206 species: Archae - 2; Bacteria - 17; Metazoa - 284; Fungi - 124; Plants - 126; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 64 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:150265..150922 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12397.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 110 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESNRGQGSI QQLLAAEVEA QHIVNAARTA KMARLKQAKE EAEKEIAEYK AQTEQDFQRK LEETSGDSGA NVKRLEQETD TKIEQLKNEA SRISKDVVEM 101: LLKHVTTVKN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)