AT2G47920.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.647 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Kinase interacting (KIP1-like) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Kinase interacting (KIP1-like) family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: KIP1-like (InterPro:IPR011684); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Kinase interacting (KIP1-like) family protein (TAIR:AT1G03470.2); Has 342 Blast hits to 342 proteins in 46 species: Archae - 2; Bacteria - 4; Metazoa - 5; Fungi - 4; Plants - 321; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:19616003..19616761 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26490.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 225 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVREEEKSRW WWFESHKSSK HSQWLQSTLA EIDAKTKAML KLLDGNADSF AQRAETYYKK RPELISFVED FYRAHRSLAV NFDHLKSSDH YGSRSAKVPQ 101: QSMESVCDSN SHFEDADSEI EDPLQDDASA ADCKEDETWQ LEQERLKLIE ETDALRKQLL DKDEEKREVI RQLSLTLETL KDENLSLKRR LAHHSLKQRT 201: VLEFKPLNKF FGKLFYIMCD GNKVL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)