AT2G44790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : uclacyanin 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a uclacyanin, a protein precursor that is closely related to precursors of stellacyanins and a blue copper protein from pea pods. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
uclacyanin 2 (UCC2); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, copper ion binding; LOCATED IN: anchored to plasma membrane, anchored to membrane; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plastocyanin-like (InterPro:IPR003245), Cupredoxin (InterPro:IPR008972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: uclacyanin 3 (TAIR:AT3G60280.1); Has 7774 Blast hits to 4337 proteins in 447 species: Archae - 19; Bacteria - 1100; Metazoa - 1380; Fungi - 511; Plants - 3296; Viruses - 503; Other Eukaryotes - 965 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18462182..18463232 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20355.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 202 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMNGLSKMA VAAATALLLV LTIVPGAVAV TYTIEWTTGV DYSGWATGKT FRVGDILEFK YGSSHTVDVV DKAGYDGCDA SSSTENHSDG DTKIDLKTVG 101: INYFICSTPG HCRTNGGMKL AVNVVAGSAG PPATPTPPSS TPGTPTTPES PPSGGSPTPT TPTPGAGSTS PPPPPKASGA SKGVMSYVLV GVSMVLGYGL 201: WM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)