AT2G43200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.618 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT4G00750.1); Has 1253 Blast hits to 1210 proteins in 135 species: Archae - 14; Bacteria - 180; Metazoa - 5; Fungi - 11; Plants - 985; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 58 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:17958230..17960536 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70240.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 611 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNPSQQHLPK LCPKRLFLFF TPFLLFSLYY ILTTIKTITI SSQDRHHPPQ LHVPSISHYY SLPETSENRS SPPPLLLPPP PSSSSSLSSY FPLCPKNFTN 101: YLPCHDPSTA RQYSIERHYR RERHCPDIAQ EKFRCLVPKP TGYKTPFPWP ESRKYAWFRN VPFKRLAELK KTQNWVRLEG DRFVFPGGGT SFPGGVKDYV 201: DVILSVLPLA SGSIRTVLDI GCGVASFGAF LLNYKILTMS IAPRDIHEAQ VQFALERGLP AMLGVLSTYK LPYPSRSFDM VHCSRCLVNW TSYDGLYLME 301: VDRVLRPEGY WVLSGPPVAS RVKFKNQKRD SKELQNQMEK LNDVFRRLCW EKIAESYPVV IWRKPSNHLQ CRKRLKALKF PGLCSSSDPD AAWYKEMEPC 401: ITPLPDVNDT NKTVLKNWPE RLNHVPRMKT GSIQGTTIAG FKADTNLWQR RVLYYDTKFK FLSNGKYRNV IDMNAGLGGF AAALIKYPMW VMNVVPFDLK 501: PNTLGVVYDR GLIGTYMNWC EALSTYPRTY DLIHANGVFS LYLDKCDIVD ILLEMQRILR PEGAVIIRDR FDVLVKVKAI TNQMRWNGTM YPEDNSVFDH 601: GTILIVDNSI K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)