AT2G41890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.809 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : curculin-like (mannose-binding) lectin family protein / PAN domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
curculin-like (mannose-binding) lectin family protein / PAN domain-containing protein; FUNCTIONS IN: sugar binding, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Apple-like (InterPro:IPR003609), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G34300.1); Has 27641 Blast hits to 27042 proteins in 566 species: Archae - 0; Bacteria - 139; Metazoa - 3969; Fungi - 187; Plants - 22616; Viruses - 64; Other Eukaryotes - 666 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:17478058..17480352 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 85861.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 764 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKMLRALLLC LSLVFFLAFQ IVVSEIQLGS KLVVGENTLW VSNNGDFALG FFNPPGLLNR FSIGIWFNSN SIPYDQRKVV WVAGAGVVVS DNSSYFELTR 101: NGELVLFDSL LGVPVWNSKT NRFSVSSALL RDDGNLVLLK DREEIVWQSF GTPTDTLLPN QKFPAFEMLR AASENSRSSY YSLHLEDSGR LELRWESNIT 201: FWSSGNEVVK KKKKKKNIGA VLTSEGALFL EDQDLMRPVW SVFGEDHNDT VKFRFLRLDR DGNLRMYSWN EDSRIWKPVW QAVENQCRVF ATCGSQVCSF 301: NSSGYTECNC PFNAFVSVSD PKCLVPYQKP GCKSGFNMVK FKNLELYGIY PANDSVISQI SSQRCKKLCL ENSACTAVTY TNDGEPQCRM KLTRYISGYS 401: DPSLSSISYV KTCLDPIAVD PNNVSKESPV TVTKSHSICI PCLVGATSTT LVLFLGFQLG IVVYIYRRKK KLAKKKAERF SKATNPKGVM IFSVDEIKAM 501: TDNFDNNIGP QIFKGVMPEN ELVAVKEVEA TLTEERKFRS SASKIGTMHH KNLANLEGYC CELGRRFLVY EYAKNGSILD HIVDPLRSKK LTWRIRTDTC 601: LSVAKALCYL HMECREFVSH GNLNCGNILL GEDLEAKLTE YGFGLCAADK DVEDFGKTVL ALITGRYEPE GVVSEWVYRE WIGGRKETVV DKGLEGCFDV 701: EELERVLRIS FWCVQTDERL RPSMGEVVKV LEGTLSVDPP PPPFACARSS PTNSSESSQS LYEP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)