AT2G36890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Duplicated homeodomain-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Putative homolog of the Blind gene in tomato. Together with RAX1 and RAX3 belong to the class R2R3 MYB genes; encoded by the Myb-like transcription factor MYB38, regulates axillary meristem formation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
REGULATOR OF AXILLARY MERISTEMS 2 (RAX2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SANT, DNA-binding (InterPro:IPR001005), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), Myb, DNA-binding (InterPro:IPR014778), HTH transcriptional regulator, Myb-type, DNA-binding (InterPro:IPR017930), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287), Myb transcription factor (InterPro:IPR015495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: myb domain protein 37 (TAIR:AT5G23000.1); Has 8785 Blast hits to 8145 proteins in 459 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 710; Fungi - 476; Plants - 5916; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 1679 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:15485821..15487245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34059.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 298 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRAPCCDKA NVKRGPWSPE EDAKLKDYIE KQGTGGNWIA LPHKAGLRRC GKSCRLRWLN YLRPNIRHGD FTEEEDNIIY SLFASIGSRW SVIAAHLQGR 101: TDNDIKNYWN TKLKKKLIAT MAPPPHHHLA IATSSSSASP SSSSHYNMIN SLLPYNPSTN QLLTPHQGIM MTMMGQQQQL FYQEDMGNLV NSPNRNNLIM 201: SHQEDNQEQS TNKGIMLLSD VRSGSSTTST VTRVKMEHRD HDDHHHHHEE DERSMTSVVM EDYGMEEIKQ LISSSCTSSN NSLWFDENKT EDKFMLYY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)