AT2G32100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ovate family protein 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ovate family protein 16 (OFP16); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF623 (InterPro:IPR006458); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ovate family protein 12 (TAIR:AT1G05420.1); Has 251 Blast hits to 251 proteins in 22 species: Archae - 0; Bacteria - 16; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 235; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13647852..13648586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27063.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 244 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPKILWKSLH LCFPSNLTKC YSSPCIPPSS ADPDGIIQPN RPSIVLLNNF NLLYHNDNHH HPHRVIDLPS SSTTTTPAAT SSSSTSSYES DISPDVSAAF 101: ASRRFFFSSP GRSNAITDSP EPRSREFSDN YDDATITSTK KKKKKVYDNS VTTTTTRLIS GGTAVTQHVD SPDPLTDFRR SMQEMIDAAI DAGELSRDPN 201: DGYDFLDELL LTYLSLNPAD THKFVIRAFS DILVSLLSEE RRIC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)