AT2G31440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.670 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
INVOLVED IN: positive regulation of catalytic activity, protein processing; LOCATED IN: integral to membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aph-1 (InterPro:IPR009294); Has 268 Blast hits to 262 proteins in 79 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 212; Fungi - 0; Plants - 34; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 22 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13399309..13400971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27537.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 250 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTVAAGIGYA LVALGPSLSL FVSVISRKPF LILTVLSSTL LWLVSLIILS GLWRPFLPLK ANVWWPYALL VITSVCFQEG LRFLFWKVYK RLEDVLDSFA 101: DRISRPRLFL TDKLQIALAG GLGHGVAHAV FFCLSLLTPA FGPATFYVER CSKVPFFLIS AIIALAFVTI HTFSMVIAFE GYAKGNKVDQ IIVPVIHLTA 201: GMLTLVNFAS EGCVIGVPLL YLVASLTLVH CGKMVWQRLL ESRNQSSASR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)