AT2G30040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of MEKK subfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 (MAPKKK14); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 (TAIR:AT1G07150.2); Has 109483 Blast hits to 108488 proteins in 3028 species: Archae - 134; Bacteria - 12042; Metazoa - 41245; Fungi - 11323; Plants - 26137; Viruses - 476; Other Eukaryotes - 18126 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12821747..12823138 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51677.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 463 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKQNIISNT SSSSSSWIRG SCVGRGCFGT VSKALSKIDG GLFAVKSIDL ATCLPSQAES LENEIVILRS MKSHPNIVRF LGDDVSKEGT ASFRNLHLEY 101: SPEGDVANGG IVNETLLRRY VWCLVSALSH VHSNGIVHCD VKSKNVLVFN GGSSVKLADF GSAVEFEKST IHVSPRGSPL WMAPEVVRRE YQGPESDVWS 201: LGCTVIEMLT GKPAWEDHGF DSLSRIGFSN DLPFIPVGLS ELGRDFLEKC LKRDRSQRWS CDQLLQHPFL CQDHHDSFFT ESSPRCVLDW VNSEFDEEEE 301: SDEWRPESMV SAMARISKLA ITGGANWESN GWTEVRDTSE ESEAKKEVLV SPRVELESYI SLESSSDDSV RQPRNEESAT ELASAVTCEA ILLVMILVVE 401: NIQIYATFYT SSIIMHILYC CSCCCYYHYQ NNNKKNNFSK STSFILSLNF LFGIACDSDR SIY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)