AT2G27220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BEL1-like homeodomain 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
BEL1-like homeodomain 5 (BLH5); FUNCTIONS IN: DNA binding, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: regulation of transcription, DNA-dependent, regulation of transcription; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: embryo, leaf whorl, flower; EXPRESSED DURING: petal differentiation and expansion stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Homeobox, conserved site (InterPro:IPR017970), Homeobox (InterPro:IPR001356), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), POX (InterPro:IPR006563), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BEL1-like homeodomain 1 (TAIR:AT2G35940.3); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11637306..11639537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48820.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 431 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAFFLGESE MREHSSDLFM MTLNPFREQT TTTNAHDDHF YNLCFGSQQY RPRDEVGHIE QGNSSISTFS NGGVFRALAP IYLKAAQELL NEIVNVGNGS 101: HGAKQERPVS KESTIYGVED INGGYKPGVA ALQMKKAKLI SMGEMVEQRY KQYHDQMQTI ISSFEQAAGL GSANSYTHMA LQTISKQFRA VKDMISLQIK 201: QINKLLGQKE FDEQLKKLGK MAHHHSNAWR PQRGLPEKAV SVLRSWLFEH FLHPYPRDLD KVMLAKQTGL TKSQVSNWFI NARVRMWKPL VEELYSEEMD 301: IEESRKGSDR YSTKGSSSKQ PYNNTTSNES SNTILPAFRQ GFTETETPRQ NSSSSCSVVM RFTKQHMNQA NFINFNGGFE NYHTMDGNSV SLSLGLPHSC 401: DQTFNNIHFE STSHGTENSA IYSSSTYQIM D |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)